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实验室建设与采购

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【原创】慎做基因芯片

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楼主 rockie2000
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这个帖子发布于11年零264天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
基因芯片的广告铺天盖地，关于基因芯片的很多宣传也让人热血沸腾，例如：那个人、那篇文章做了基因芯片发了大文章；有如：宣传者拿出一个大列表让你看，这么多高分的杂志都是用了基因芯片。好像这个价格不菲的东东档次很高，也能给你的实验找到一个突破口，也能让你发篇大文章，至少是一篇SCI，甭管分高分低。
但实际上，总结身边几个做过基因芯片的人，都对芯片没什么好感觉或者好印象。做之前很兴奋，似乎结果拿到手了就什么都解决了。其实不然，拿到手的只是原始数据，而且不是全部的点，芯片之中有的点因为这样或者那样的原因被认为不可靠剔除掉了，只能拿到一部分点。
一般的结果处理就是把上调2倍的基因拿出来验证，如果较多，就上调到5倍、10倍，等等。更高级点的，就要基因分析了。
说到基因分析，更是让人恼火。为你做芯片的公司是不负责分析的，只负责做出原始结果。理由是：我们没有分析软件。去别的公司分析还要很高费用，少则数千，多则上万。分析软件有的是国外公司开发的，有的是国内公司自己开发的，良莠不齐，都说自己的好。目前还没有非常成熟的方法。
个人感觉基因芯片就像中国的保险，买之前什么都好，买之后问题多多。基因芯片还有很长的路要走。
一家之言，仅供参考。
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2009-04-29 20:00 浏览 : 52263 回复 : 10
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rockie2000 编辑于 2009-05-31 10:51
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flyerchen
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怎么了
2009-05-04 08:48
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ebio66
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我是芯片公司的，做了10年的芯片销售。谈一谈我的看法：芯片没有那么好，但也没有那么差；或者说，芯片可以解决部分问题，但无法解决全部问题。说没有那么好的意思是，芯片和其他很多方法一样，有自身的局限和应用。有的老师只做1张或2张芯片，就想依靠芯片发表多高的文章，这是不太现实的。曾有老师找我们说拿10万做芯片，能否发表5分以上的文章，我们交流了实验思路后认为还是很难。说没有那么差的意思是，芯片还是可以解决一些问题。芯片在肿瘤研究、遗传病研究、药物研究等诸多领域都有很好的应用，可以快捷找到marker等。而且现在已经从最初的表达谱芯片发展到比较基因组学、甲基化芯片、SNP、chip-on-chip、miRNA等，应用越来越广泛。不妥之处，欢迎批评！
2009-05-05 12:14
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楼主 rockie2000
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ebio66
我是芯片公司的，做了10年的芯片销售。谈一谈我的看法：芯片没有那么好，但也没有那么差；或者说，芯片可以解决部分问题，但无法解决全部问题。说没有那么好的意思是，芯片和其他很多方法一样，有自身的局限和应用。有的老师只做1张或2张芯片，就想依靠芯片发表多高的文章，这是不太现实的。曾有老师找我们说拿10万做芯片，能否发表5分以上的文章，我们交流了实验思路后认为还是很难。说没有那么差的意思是，芯片还是可以解决一些问题。芯片在肿瘤研究、遗传病研究、药物研究等诸多领域都有很好的应用，可以快捷找到marker等。而且现在已经从最初的表达谱芯片发展到比较基因组学、甲基化芯片、SNP、chip-on-chip、miRNA等，应用越来越广泛。不妥之处，欢迎批评！

没有人期待1张或2张芯片发表高文章，这是某些人自说自话。芯片公司承诺的全部技术服务是不完整的，只提供原始数据。小芯片筛出几个、几十个基因也就罢了。大的芯片筛出了上千个、甚至几千个上调2倍的基因交到你口中的老师手里，他不是芯片分析专业人士，如何使用？这时芯片公司会推荐其他的公司作分析，一张口就是先6000-8000块，以后的会优惠。给人感觉就像上了贼船一样。
做芯片的公司不能只把广告做好，技术服务也要跟上。
2009-05-31 11:03
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